Cell | 自体疾病中自体细胞特异基因调控动态全景图

东京大学的研究工作医护人员和RIKEN Research研究工作所的同事们之前设立了首个针对自身免疫反应性病因和自身水肿性病因的遗传数据集库。期望这一资源能为免疫反应病因的演进提供新的学说，并可能更进一步药物的发现。研究小组们还期望，与免疫反应特别的遗传组数据集图解再度可能应用于诸如COVID-19等登革热的研究工作。

东京大学项目研究工作顾问，针灸风湿病学家，功能性遗传组学医学专家Mineto Ota博士却说：“要理解病因，就需要深刻理解遗传性状的功能性。有了这个数据集集，我们就可以将与病因特别的DNA序列巨大变化的数据集与对病因肺癌机制非常重要的遗传和线粒体子类联系慢慢地。”Ota是该的团队发表在《Cell》杂志上的评论的主要笔记，评论书名为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的研究小组们合作来进行的。

笔记说道，免疫反应介导的病因（IMD）以外从自身免疫反应性到自身水肿的多种组织学。他们提到，尽管IMD当中炎性线粒体因子的异常活动表明免疫反应线粒体功能性愈演愈烈了巨大变化，但是，“对于IMD的特别遗传甚至特别线粒体子类知之甚少。”

全都遗传组关连性研究工作（GWAS）发现了许多与IMD特别的遗传组核苷酸。但是，在此类关连性研究工作当中鉴定单单的许多遗传性状都座落在调节遗传“on”或“off”表示的DNA非编码地区，而不是座落在遗传编码序列当中。研究工作小组提到：“GWAS之前揭示了许多与复杂性状和病因特别的遗传组核苷酸，以外IMD。这些性状当中的大多数都座落在非编码遗传组地区，尤其是调节元件，如增强子和启动子。”

为了揭示调节DNA的功能性，一种完全都相同子类的遗传组分析，叫做表示定量性状遗传核苷酸（eQTL），旨在将DNA序列的歧异与遗传表示的歧异联系慢慢地。依靠eQTL数据集，研究工作医护人员可以对调节DNA序列的目的、调节序列当中的性状如何影响其调节遗传的表示以及这些遗传表示歧异如何导致病因做单单更慎重的猜测。

其它针对免疫反应的eQTL研究工作之前在来进行当中，但在此之后的研究工作工作只以外肥胖自愿者，并检查了有限生产量的线粒体子类。研究工作医护人员说道：“对肥胖NADPH免疫反应线粒体的研究工作可能未捕获病因状态下发现的一系列eQTL不稳定性。此外，虽然对免疫反应线粒体的各种类型刺激可以在不太可能上模拟器病因状态，但并不一定似乎反映单单体内的病理环境。”

Ota不足之处道：“水肿状态下，免疫反应线粒体的物理物理性质与肥胖状态下的相同线粒体截然完全都相同。与免疫反应原因特别的遗传性状可能只在病重状态下起作用，因此对于这种子类的遗传研究工作，从真正症状头上给与样本非常重要。”

在他们简介报道的研究工作当中，研究工作小组对79名肥胖自愿者和337名被确诊患有10种完全都相同子类免疫反应介导病因（以外类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮和系统性抑郁症）的症状来进行了全都遗传组测序。所有自愿者都是韩国血统。

理解免疫反应介导的病因具有挑战性，因为尽管每种病因在针灸上都是完全都相同的，但仍有许多重叠之处，并且具有相同确诊的症状可能会表现单单非常完全都相同的症状。研究工作医护人员不足之处却说：“由于所有这些多样性，一次学习一种免疫反应介导病因的能力是有限的。但是，如果我们一起研究工作10种病因，就可以更全都面地理解这些子类的病因。”

在完成全都遗传组测序后，研究工作医护人员从自愿者的血液样本当中分离单单28种完全都相同子类的免疫反应特别线粒体，并测量了这些线粒体当中的遗传表示。“我们在图解当中看到，每种免疫反应线粒体子类都有完全都相同的eQTL结果，这可以并不知道我们线粒体子类彼此之间遗传调节的歧异，以及哪种线粒体子类对于演进哪种病因至关重要。”研究工作医护人员却说。

笔记报告却说，“在遗传表示分析当中，我们在一个平台上对多个IMD来进行比较，使我们能够详细描述每个病因（症状）的特征，并识别与单个病因特异性特别的遗传，以及在一组IMD当中亢进的通路……我们的数据集集使我们能够检测每个特定线粒体子类当中eQTL不稳定性的病理（病因）着重驱动的分心。”

研究工作医护人员将得到的资源命名为东京大学免疫反应线粒体遗传表示图解（ImmuNexUT），并却说它代表了使用东亚血统自愿者设立的最大的eQTL数据集集。他们回顾道：“我们确定了免疫反应线粒体子类特异性的eQTL不稳定性，以外在此之前未报道的罕有线粒体子类，它们在病理水肿条件下的多样性，以及这些eQTL与IMD遗传彼此之间的显著关连性。”

“到现阶段，在这一教育领域，大规模的遗传组和功能性遗传组研究工作主要是依靠当中欧这些年来来进行的，尽管群体多样性对于直观理解遗传组功能性至关重要。”研究工作医护人员却说，“这个韩国患者的eQTL图解对于克服这种以当中欧为当中心的成见，结合当中欧的数据集集全都面研究工作DNA性状的功能性，也具有重要意味。”

研究工作医护人员期望ImmuNexUT数据集库将继续增长，并再度为症状带来更好的结果。他们却说：“与之前报道的资源相比，我们的数据集集具有奇特而有利的特点，以外全都面的免疫反应线粒体拆成、这些年来彼此之间免疫反应原因的巨大变化以及同质的非当中欧这些年来。”